Родился в Ереване. Сергей Карапетян был известен также под именем «Лалик». С 5-6 лет он пел народные песни, затем начал играть на кларнете. Музыкальную деятельность Карапетян начал в ансамбле народных инструментов под руководством Артема Меджиняна, а творческую деятельность - в группе Вардана Буниатяна. С 1952г., в течение года, работал в группе Гургена Мирзояна. В 1964г. был принят в ансамбль народных инструментов радио и телевидения Армении. С 1978 г. – солист ансамбля. С 1978 по 1988гг. работал в Ереванском музыкальном училище им. Саят-Нова, где был первым преподавателем отделения дудук-шви (свирель). Карапетян гастролировал во многих странах мира. В 1989 г. Сергею Карапетяну было присвоено звание Заслуженного артиста Армении, в 2008 году был удостоен медали «Мовсес Хоренаци» Республики Армения. Умер в Ереване.