Родился в Греции. В 1947г. Алмухян переехал в Аргентину (Буэнос-Айрес), где получил музыкальное образование. В 1957г. он основал общество «Друзья армянской музыки» и хор «Аракс», где был художественным руководителем. Под его руководством хор выступал с программой, где представлялись почти 400 армянских, аргентинских произведений и музыка других национальностей. Гастролировали на Ближнем Востоке, Южной Америке, Иране, Европе и т.д, были удостоены государственных наград и премий. Композитор Жан Алмухян писал музыку для хора, камерные, симфонические произведения, концерты для скрипки, фортепиано, песни на слова армянских поэтов. С 1960 по 1980гг. неоднократно гастрорировал в Армении. Алмухян - член Союза композиторов Аргентины. В 1972г. был награжден орденом «Св. Месроп Маштоц» Католикосом Киликийским Хореном Первым, а в 1982 г. – орденом армянской церкви «Св. Саак – Св. Месроп» Католикосом Всех армян Вазгеном Первым. В 1987 г. Алмухян был удостоен Премии имени Комитаса Министерства культуры РА и Союза композиторов Армении, в 2013 г. – награжден орденом «Мовсес Хоренаци» Республики Армения.